艾滋慢性腹泻

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TUhjnbcbe - 2020/9/27 18:13:00

编者按

新型冠状病*蔓延,相关研究也迅速出炉[1]。1月21日,科学家发表了新型冠状病*的蛋白模型[2]——这些数据说明了什么?新冠病*与非典病*有何异同?

本文作者来自英国帝国理工学院,博士生期间的课题同样围绕于病*蛋白模型,且所用技术与这次研究相同。对于这次的研究数据,她提出了自己的解读(以下仅代表作者个人观点)。

新型冠状病*(-nCov),与之前的非典病*(SARS)、中东呼吸综合症冠状病*(MERS)都属于冠状病*。目前,已知能够感染人类的冠状病*有7种,上述3种可以引起致命的呼吸系统疾病,剩下的4种则是人类感冒的常见病原体。

什么是冠状病*?

冠状病*是一类RNA病*的总称,这类病*的遗传物质为RNA。之所以叫做“冠状病*”,是因为在电子显微镜下,病*边缘上的突起——刺突蛋白(S)看上去就像皇冠一样。

冠状病*的结构:刺突蛋白(S)与HE蛋白是进攻武器,帮助病*进入人体细胞;膜是防御武器,帮助病*存活更久;核壳蛋白(N)是辅助武器,帮助病*有效复制;RNA基因组则是病*的真身

参考资料[3]

这个“刺”,是病*进入人体细胞强有力的武器,它可以跟人体细胞表面一种叫做ACE2的受体结合,病*借机进入到细胞中去——简单来说,ACE2受体是锁,刺突蛋白(S)是钥匙;通过这把可以匹配的钥匙,病*才能够进入细胞。病*进入了细胞之后,就会现出RNA病*的真身。RNA病*自己生不出小病*,但它可以让宿主细胞像一个工厂一样,按照病*RNA遗传信息的指示,源源不断地复制出更多的新病*。

上面所说的受体ACE2,叫做血管紧张素转化酶,广泛存在于人体各组织,但在肺毛细血管中的活性最高。所以,身体的各个组织都有可能先被病*感染,但绝大部分初期症状都体现在呼吸系统。

如果能够成功截断“开锁”的过程,从理论上来说,就能有效地将一大波病*拒于细胞的门外,让它们从一开始就不能感染我们。因此,这把钥匙——刺突蛋白(S)是很多学者研究的方向,也是抗击冠状病*的方案之一。

新型冠状病*和非典病*都有自己的刺突蛋白(S),这两个蛋白有些相似,却又不完全一样。最近发表的这篇论文[2],比较了两个病*的刺突蛋白(S),概括来说有以下三点:

1)从氨基酸序列来说,新型冠状病*跟非典病*有76.47%的相似率。

2)从3D空间来说,模拟出来的新型冠状病*跟非典病*的3D结构非常相似。

3)从与人类受体结合的能力来说,非典病*更容易与人类受体结合。

这些数据是什么意思?

1

氨基酸序列

根据论文公布的数据,新型冠状病*与非典病*,在氨基酸序列上有76.47%的相似率。

个人觉得,对于不同蛋白来说,76.47%的相似率还是比较高的。比如,我研究的艾滋病*辅助蛋白Vpu,单链一共只有81个氨基酸,在不同的蛋白亚型里,也会有十来个不同的氨基酸。以MERS为例,MERS的刺突蛋白(S)有个氨基酸,可变几率也会更大。而不同的蛋白质,区别可能也会更大。

但重点是,氨基酸变了,不一定会影响蛋白质的整体功能。这就好比,做菜的时候要放白砂糖,但如果不小心放成了冰糖,也许口感有那么一点区别,但反正都是甜的;当然,如果放成了盐,那区别就大了——氨基酸链也是如此,氨基酸的改变,可能是白砂糖和冰糖的区别,也可能是糖和盐的区别。

相比之下,氨基酸排列引起了可能的结构变化,继而导致了功能变化,后两者才是我们更看重的。

蛋白质的一级结构是一串氨基酸

NationalHumanGenomeResearchInstitute

2

3D空间结构

关于论文里讨论的3D结构,可以简单理解为,模拟出来的这两个刺突蛋白(S),在空间距离上的差异有多少米,也就是它们的空间结构有多相似。结果发现,它们差了1.45?,也就是0.米。你没看错,1?=1^-10米。再考虑到这个刺突蛋白(S)的普遍长宽,一般为长=30nm,宽=5nm(1nm=1^-9米)[4],这样的差异是非常小的。

因为,蛋白质不是静止不动的。在实际情况下,蛋白质会蹦来蹦去,扭来扭去,好比一根弹簧。蹦一下,这个1.45?的差距就没了。所以,这两个蛋白质的3D空间结构是非常相似的。

蛋白模型:红色表示ACE2受体蛋白,棕色表示新型冠状病*刺突蛋白(S),蓝色表示SARS病*刺突蛋白(S)

参考资料[1]

3

蛋白质功能

空间结构近乎相同,那么功能呢?沿用之前的“钥匙和锁”模型,这两把长得差不多的钥匙都能开锁吗?答案是——可以的,只不过非典病*的这把钥匙开得更顺畅。

论文此处比较的是刺突蛋白(S)与人体细胞受体ACE2的结合。新型冠状病*与受体的结合自由能是-50.6kcal/mol,非典病*是-78.6kcal/mol。结合自由能越低,病*蛋白和人类受体结合时释放的能量就越多,结合也就越稳定。因此,相比之下,非典病*与ACE2受体的结合更稳定。

但是,这并不代表新型冠状病*与ACE2受体结合得不好,只能说非典病*更好。论文指出,一般来说,结合能量为-10kcal/mol时,就该认为结合得不错。

这说明了什么?

新型冠状病*与人类受体结合得不错,但没非典病*那么好——从这个信息,我们可以试着推论出这次病*的几个特点。

1

入侵能力

非典病*的结合率更好,意味着就单个病*而言,非典病*更容易进入人体,人体也就更容易被感染。因此,有学者认为,新型冠状病*的传染性没有非典病*强,我也同意这个说法。

2

传染性

然而,正是因为相比于非典,这次的病*没有那么容易进入细胞、造成破坏,所以人类感染初期的症状也就不那么明显。这样一来,受感者不会警觉,可能也会出现漏诊、误诊的情况;由于错失及早就医的时机,受感者也更有可能感染其他人——所以,从这个角度来说,这次的病*传染性强。

当然,这只是病*传播的一个因素。病*的致命率、生命周期、传播渠道、在空气中可以滞留多久、病*量、在进入人体细胞后复制新病*的速度等等,都能够影响病*的传染力。

新型冠状病*的电镜图片

中国疾控中心

3

病*对人体的影响

病*对人体的影响,是由病*本身以及人体免疫系统的反应共同决定的。

如果一个病*的杀伤力很强,人体的免疫系统很弱,病*一进来,就把人体细胞杀精光,那么这个病*对人体的影响肯定是很大的。但是,如果一个病*本身的杀伤力不强,人体免疫系统的反应却过于强烈,挥起宝刀一阵乱打,结果打的都是自己人,那么人类正常的细胞也会被过激的免疫系统弄死——这种情况下,我们也说这个病*对人体的影响很大。正常的免疫反应,应该是按部就班进行的,太快太慢都不行。

研究发现,非典病*更倾向于“打倒”青年人,是因为青壮年的免疫系统比较好,更加灵敏、强烈,而非典病*的结合能力强,更容易导致免疫系统的过激反应[5]。然而,这次的新型冠状病*结合能力虽不差,但却没有非典病*那么好,免疫系统的反应相对缓和一些。也就是说,比较强的免疫系统能有较多时间反应,从而作出正常的部署;但是,免疫系统比较弱的人,就很容易中招。

从最近报道的病例来看,这次整个病症的周期比非典长;同时,根据《柳叶刀》的最新研究,中老年人也更容易感染这次的新型冠状病*——其实,更准确的说法应该是,单从新型冠状病*的结合能力来说,不论年老年少,免疫力弱的人都更容易中招。

不论年龄,免疫力弱的人都更容易中招

Pixabay

从实际来看,初期弱弱的症状、春运、春节家庭聚会,这些都给新型冠状病*带来了很好的传播机会。假期里减少多人聚集,尽量在家隔离,开工之后也不要掉以轻心,做好防护,别急着呼朋唤友聚餐蹦迪——不给病*传播的途径,这才是最稳妥的方法。

注:本文基于理论研究,并不能代表专家和一线医生的观点。仅供参考,如有错误,欢迎指正!

参考资料

[1]NewChinavirus:Sivequestionsscientistsareasking,E.CallawayandD.Cyranoski,NatureNews,

[2]EvolutionofthenovelcoronavirusfromtheongoingWuhanoutbreakandmodelingofitsspikeproteinforriskofhumantransmission,X.Xuet.al.,ScienceChinaLifeSciences,

[3]Wikipedia:Coronavirus,scientificanimations.

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